所有的分析都需要对snp进行LD过滤 常见的群体结构的分析方法有admixture分析、系统发生数分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1）R语言绘图 admi...
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GWAS | 4.群体遗传结构、PCA、进化树
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2-群体遗传的基础介绍1 易混淆的概念 等位基因（alleles）基因型（genotypes）单倍型（Haplotype）二倍型（Diplotype） 基因座位 VS. 等位基因 两者的区别关键：...
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1-群体遗传的基础介绍群体遗传学狭义上是指分子群体遗传学，主要是研究基因组内突变在群体中频率的升高或降低。研究内容有：群体结构，迁移史，群体有效群体大小。通过一些模型对上述内容进行分析。 以下前5...
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选择压力分析，从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks）之间的比例。 一般认为，同义...
