“ 话不多说，直接开始今天的主题——给大家梳理一下如何通过测序得到的序列获得最后呈现给读者的系统发育树！” 1、序列准备： 通过测序获得需要鉴定的目标菌株的序列信息，一般细菌...
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菌种鉴定——如何构建系统发育树 -
2023-03-27系统发育树最近在做基因家族分析。拿到了基因家族成员的序列之后，当开始做进化树时就遇到了些问题，然后就在网上搜索了些教程，和一些网站。 一、首先说一下发育树 系统发育树（Phylogen...
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一文讲完叶绿体基因组比较分析的全部软件和配套ggplot绘图脚本前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教程之零散，各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此，列出个人...
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mVISTA学习mVISTA[http://genome.lbl.gov/vista/mvista/submit.shtml]是常用的叶绿体基因组比对图的绘制程序，但是输入文件需要满足mVI...
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REPuter注释叶绿体重复序列REPuter可注释叶绿体重复序列，包括4种类型，Forward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPu...
