整理的非常详细,辛苦了
10X空间转录组空间高变基因联合组织区域识别之SpatialDE2hello,大家好,又到周五了,今天给大家带来一个新的分析内容,空间高变基因联合算法推断区域识别的方法,SpatialDE2[https://github.com/PMBio...
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你的connect函数写错了,应该加载SeuratDisk包,用Connect函数读入,注意C大写。
loom文件转换成seurat对象GEOdatabase下载了一个.loom文件,想要用一下这个数据,折磨了一周,终于成功的将它转换成了seurat对象,现记录如下:数据为GSE162183,地址:https...
命令 {for id in KOAC KONC WTAC WTNC do ... } 只能对多个数据进行先后分析,无法对多个数据进行并行分析,耗时过长,请问有什么方法可以实现嘛?
PBS脚本 提交任务1.创建PBS脚本 #如何在linux下创建一个可运行shell脚本 #新建一个.sh文件 touch cellranger.count.sh #编辑test.sh文件 vi...
作者有没有注意到bin越大,相关性越强?所以bin的大小该如何选择?500bp?or 10000bp?
使用deeptools计算ChIP-seq样本之间的相关性整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 当我们需要评估ChIP-seq类测序数据的相关性时,deeptools[...
亲爱的简书用户 「简书」因个别上传作品用户违反《中华人民共和国网络安全法》《互联网信息服务管理办法》《互联网新闻信息服务管理规定》《互联网用户公众账号信息服务管理规定》《移动...
@是峰峰峰啊 正相关就是随着表型变化,模块的整体表达量升高,反之则下降。
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
统计弄懂了,生信差不到哪儿去
《Modern Statistics for Modern Biology》Chapter 停看——统计基础跟不上了,先了解以后再回来吧《Modern Statistics for Modern Biology》Chapter 一: 离散数据模型的预测(1.1 - 1.3) 《Modern Statistic...
看样子又让你心动了
MD-什么是泛基因组学? 怎么构建物种的泛基因组?应用?什么是泛基因组学? 怎么构建物种的泛基因组?应用? 什么是泛基因组学? 怎么构建物种的泛基因组?应用? 参考链接:http://www.chem17.com/Tech_new...