你好呀,请问使用HiFi+Utralong_nocorrect+HiC组装后需要polish吗,我认为是不用吧,但又不太确定
「基因组」hifiasm重大更新:支持Utralong ONT数据组装hifiasm下载地址 截止今天为止,hifiasm官网更到0.19.3版本(五天前更新!!!):https://github.com/chhylp123/hifiasm/r...
你好呀,请问使用HiFi+Utralong_nocorrect+HiC组装后需要polish吗,我认为是不用吧,但又不太确定
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hifiasm下载地址 截止今天为止,hifiasm官网更到0.19.3版本(五天前更新!!!):https://github.com/chhylp123/hifiasm/r...
请问一下,我们该如何确定祖先染色体数量嘞,结果中有数百个CAR
使用Agora/ANGEs构建祖先核型0.忘了是在那篇文献看到的,用了Agora,再把Agora的输出结果喂给ANGEsAgora和ANGEs都是构建祖先核型的软件个人实测是Agora构建的结果太碎了, ANGE...
Multiple Sequentially Markovian Coalescent (MSMC)是一种利用马尔可夫模型推断群体动态历史和群体结构的算法。能够通过输入基因组序...
同问,很奇怪,第二种情况-G 不应该直接对应的reference annotation吗,因为我像文中用的循环变量是1.1生成的“=$id/$id'.gtf'”,输出文件里面全部是STRG编号的geneid,没有生成与原始reference annotation的geneid对应关系的表,这样就无法知道哪个STRG对应reference annotation的哪个基因,所以感觉似乎不太对?或者是我没理解对?有大神能解答一下不
Stringtie的使用说明参考文献:stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads帮助文...
你好呀,请问是不是在计算群体结构前要进行连锁不平衡过滤呢,意思就是用来计算群体结构的点不能是有连锁不平衡的,这样理解对吗
玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论,通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...