拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，在发育相关研究中使用频...
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scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程 -
江湖路远，且行且吟
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你好，请教一个问题，对于非10x的数据读取有什么讲究吗。因为经常要么是读不进去，要么读进去不是想要的矩阵，即行基因列细胞
盲人摸象--single cell sequencing的Seurat学习--详细版
只有下水才会学会游泳，今天我想下水了。首先本人对单细胞测序数据的处理一无所知，但看过一些单细胞测序的文章，有一些R语言基础和跑过一些RNA-seq上游分析的经验，流程是跑过但...
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解压后有3个文件，后缀分别是mtx_cols，mtx以及mtx_rows。这种怎么读呢，我发现读进去都不是正常的矩阵（行基因，列细胞）
（二）单细胞转录组数据分析之数据质控与归一化
如果大家没有自己的数据或者没有选到合适的数据集的话，可以直接拿示例数据（10X官网演示数据）就行了。10X官网里多个演示数据：https://support.10xgenom...
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怎么判断下载的矩阵该用read table，csv或者MM呢，后缀并不准我发现。还有就是不是10x的数据，矩阵也是直接读取不需要什么处理吗
（二）单细胞转录组数据分析之数据质控与归一化
如果大家没有自己的数据或者没有选到合适的数据集的话，可以直接拿示例数据（10X官网演示数据）就行了。10X官网里多个演示数据：https://support.10xgenom...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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单细胞亚群鉴定知多少（一）
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：angelica 引言 随着单细胞技术的发展，获得单细胞数据越来越成为可能，随着单细胞数据的增多，单细胞亚群的鉴定越来越成为单细胞分析的一个关键的...
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如何定义亚群，有详细的方法吗？cellmarker数据也不怎么多
单细胞好文1--Tracing tumorigenesis in a solid tumor model at single-cell resolution
前言 我在2019年3月份写过一篇这样的文章（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？，并在文末许诺，对PPT感兴趣的小伙伴可以留言询要P...
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不做空间转录组是怎么把亚群定位到解剖的？只通过免疫荧光吗
单细胞好文1--Tracing tumorigenesis in a solid tumor model at single-cell resolution
前言 我在2019年3月份写过一篇这样的文章（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？，并在文末许诺，对PPT感兴趣的小伙伴可以留言询要P...
