您好,请教一下,公司技术告诉我,他们处理全长转录组数据,只是将完全一致的序列去掉了,相同的但是长短不一的序列会被留下。那我应该怎么处理数据,能去掉这些重复的序列呢
iso-seq全长转录本这个是我在听报告时听到的,对这个比较感兴趣,这里作为学习笔记 关于iso-seq 首先介绍下iso-seq,这是基于PacBio的单分子实时测序,隶属于三代测序,其特点是超长...
您好,请教一下,公司技术告诉我,他们处理全长转录组数据,只是将完全一致的序列去掉了,相同的但是长短不一的序列会被留下。那我应该怎么处理数据,能去掉这些重复的序列呢
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作者:Arno审稿:童蒙编辑:angelica 全长转录组测序(Isoform-sequencing,Iso-seq)基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell)...
我也是一样的问题,请问您解决了吗
基因家族专题(3):基因家族成员的鉴定Data preparation 继续上次的内容,下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下,下载好的数据。 基因组序列信息,存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...
最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多,有文献报道:比对速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),...
您好最后一步需要根据identity大于百分之多少进行进一步筛选吗
生信小白必备工具:BLAST这期开始将会系统的介绍一些生信初学者经常使用的工具,流程,敬请大家关注。首先今天和大家讲讲本地版的BLAST,一款作为生信工作者的你,这个是你每天都会用到的工具。这个网页版的...
你好,我想问下没有参考基因组,测了二代和三代数据,分析流程是否与基因组的不一样呢,那么应该如何分析呢
转录组分析入门 2 —— 基本流程⚠️ 注:此文基本全部按照 简书 刘小泽:转录组那些事儿 Part II 进行,感谢🙏,以下代码亲测有效,如有问题欢迎随时与我沟通。 准备工作😄 1. 登录服务器(本小白...