@小潤澤 是这样的，我有进行批次效应的去除，根据细胞来源不同设置了分组，现在我想看组间细胞的差异基因是否可以单独提取细胞来做呢
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...
发简信
IP属地：云南
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请问题主，如果我想要比较同一个细胞类型中不同处理细胞之前的差异，我应该选择哪一种方法呢？例如我想要比较Old_NSC 和 Young_NSC之前的差别。另外我一共有10w细胞，我发向将NSC类群单独提取出来做FindMarkers和在整体Seurat对象中进行FindMarkers分析得到的结果不同，请问可能是什么原因呢？
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...