在RNA-seq或芯片数据下游分析中经常遇到需要将基因表达矩阵行名的ensembl_id ( gene_id ) 转换为gene symbol(gene_name)的情况，而...
发简信
IP属地：内蒙古
-
ensembl_id转换与gene symbol基因名去重复的两种方法 -
ID转换专题之在线版1：biomart:ensembl_ID to gene name在线版本 线上数据库做注释和ID转换ensembl ID转成gene symbol name ensembl的biomart http://asia.ensembl.org/...
-
5、RNAseq(5)--reads count(htseq-count)与基因注释（bioMart）理论基础 在上篇的比对中，我们需要纠结是否真的需要比对，如果你只需要知道已知基因的表达情况，那么可以选择alignment-free工具（例如salmon, sailfish...
-
利用Ensembl中的BioMart将Ensembl ID转换为Gene Name1.使用浏览器搜索ensembl，点击Ensembl genome browser 104 2.点击上方工具栏中的BioMart，选择数据集(这里选Ensembl Genes...
-
生信学习-GEO数据库ID转换本文主要学习自b站混迹天然大佬[https://www.bilibili.com/read/cv14560979]以及每天都在进步的FFOO[https://www.jian...
-
-
GEO代码片段(芯片差异分析及绘图）
1.读入保存的表达矩阵数据 2.获取GPL文件并注释 3.数据检验和质控 4.聚类图和PCA图 5.差异分析 6.基因筛选 7.绘制火山图 8.绘制热图
-
GEO数据库视频学习笔记（差异分析、可视化、GSEA）笔记回顾：1.GEO数据库视频学习笔记（芯片数据下载和数据读取）2.GEO数据库视频学习笔记（ID转换）3.GEO数据库视频学习笔记（了解你的表达矩阵） 这一讲的视频地址是：...
-
小鼠基因探针注释转录组测序目前主要有两种形式，RNA-seq和microarry。这两种技术产生的数据在GEO数据库中都有很多，其中RNA-seq的数据大多是已经注释过的symbol为行名的...
-
