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    非模式生物KEGG富集分析

    写在前面 因为我研究的物种比较小众,很多注释不完全,R包AnnotationHub中也没有对应信息,所以无法使用公共数据库进行kegg富集分析。所以自己尝试使用KAAS造一个...

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    两个学习画图的网站

    我刚浏览blog的时候看到的,先保存下网址 R 这是R画图的教程:https://www.r-graph-gallery.com/ 我们看下页面 里面有很多类型的图的讲解和画...

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    R小tip(九) ggplot加label及分面

    ggplot 加label 上次我们介绍了基础作图加label,这次介绍ggplot加标签 geom_text(aes(label = round(mean, 2)), po...

  • 我想请教一下vcf文件的格式,因为我是做单细胞的snp,文件有几千个,我简单的用bcftools merge 了,但是跑SNPhylo的时候报错了:VCF file (/home/yxtu/Data/single_cell/10Xgenomics/OVAR45/later/merge.vcf) is too small to run this script!
    请问这种错误要怎么解决呢?
    多谢了!

    如何构建SNPs-based phylogenetic tree

    如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树,可以展示群体中不同个体的相互关系,基因变异相似的往往会在同一个树的cluster中,一颗好的树可以给你一个群体大概的分类(你这...

  • 您好!感谢您的分享,试了一下这似乎是精确匹配,我想改成模糊匹配应该怎么改呢

    awk 提取在第一个文件中且在第二个文件中的记录行

    1. uids.txt 111 222 333 2. log.txt aaa 111 qqq 333 www 777 fff 888 ggg 444 ppp 111 3. 脚...