文本处理是完成生信项目的基本功,能实现的方法绝对不止一种,最先想到的肯定是你比较熟悉的,这个时候谁能抵过单行命令的诱惑呢?awk是由Alfred Aho、Peter Wein...
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一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...
shenwei爪哥开发的处理Fasta/Fastq文件的万能工具。之前处理fq/fa文件时花时间写的一些脚本发现在seqkit里直接能一行命令就解决。实在是提升效率,整合流程...
2021/03/22 这是一个小任务 读取某个目录下的文件 结果是一个列表,包括此目录下所有的文件的全称 及 文件扩展名(.txt,.fasta,.gz等) 循环输出每一个文...
10x平台的双细胞率(符合泊松分布1): 根据Poisson分布,单个液滴包含超过一个细胞(doublets或multiplets)的频率随着上机细胞的浓度而改变。通常如果上...
前两天朋友圈在传一本Xiangdong Wang老师的一本书:Single-cell Sequencingand Methylation :Methods and Clin...