请问一下,您用silva注释出来的门是以riota结尾的吗,门应该都是以ria结尾的,我注释出来的很奇怪
微生物多样性qiime2分析流程(4) 训练特征分类器进行16s数据注释经过前面的分析步骤,我们得到了特征表,代表序列及进化树文件,并更改了其名称;接下来就让我们根据silva 138数据库训练特征分类器来对代表序列进行注释: 1.导入参考序列数...
请问一下,您用silva注释出来的门是以riota结尾的吗,门应该都是以ria结尾的,我注释出来的很奇怪
微生物多样性qiime2分析流程(4) 训练特征分类器进行16s数据注释经过前面的分析步骤,我们得到了特征表,代表序列及进化树文件,并更改了其名称;接下来就让我们根据silva 138数据库训练特征分类器来对代表序列进行注释: 1.导入参考序列数...
导读 宏基因组分析分为物种分析和功能分析两大块。物种组成分析是物种分析中最基本最常见的分析方法。利用R语言堆叠图,我们可以将一个项目中所有样品的物种组成展示出来。下面介绍如何...
你好,请问group_border = ddply(res.df, 'Species', function(df) df[chull(df[[1]], df[[2]]), ])这步中df1,df2是什么意思
【R语言】多边形PCA图椭圆形 多边形
楼主,我想问一下,为什么我用greengene注释出来的物种,会出现同一属的上级有两种不同的科,你有遇到这种情况么?在做stamp时分级不明确就会报错
微生物组16S rRNA数据分析小结: qiime2-2019.1本次笔记内容:qiime2-2019.1的16s分析流程,以没有barcode,以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...
本次笔记内容:qiime2-2019.1的16s分析流程,以没有barcode,以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...
您好,您是怎样把生成的qzv文件下载到MacBook本地上的,mac装不了winscp。上传和下载文件好不方便
微生物组16S rRNA数据分析小结: qiime2-2019.1本次笔记内容:qiime2-2019.1的16s分析流程,以没有barcode,以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...