轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
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我们知道在研究问题时,分组是很重要的,有分组才有故事可讲。比如,两块田一块施肥一块不施肥,可以做比较嘛。在单细胞数据分析中用到较多的数据分组技术是聚类(clustering)...
我看有的文章说是primary_assembly不包含alt-scafflod, 更适用于SNP的分析,而top_level版本适合于SNP以外的场景,更加完整的序列可以保证良好的比对率,一般下载top_level
Ensembl 简介及其参考基因组网址https://asia.ensembl.org/index.html[https://asia.ensembl.org/index.html]Ensembl是一个脊椎动...
你好,请问使用cellranger count时为什么我只得到了一些journal等临时性的文件,而不是outs结果文件呢
单细胞测序分析上游cellranger软件入门介绍公共数据库中的SRA 单细胞转录组数据究竟包含了哪些数据?CellRanger怎样利用10x平台下机数据进行下游一系列分析?这篇文章简单记录CellRanger 包括的主要分...
单细胞转录组:smart-seq2 参考资料: Smart-seq2 scRNA小鼠发育学习笔记: https://www.jianshu.com/p/23a8fcb1292...
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