发简信
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GEO数据库简介（2018-06-03）[转] GEO数据库--检索界面及检索结果简介 原文：http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fastq。 DNA甲基化及CpG岛定...
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中科院上海生科院硕博连读生。<br>
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老板亲自传授的文献阅读方法前言 论一个气场合适的导师的重要性。想起一个微信朋友前截图 A：导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，跟你牛不牛没有关系 B：你错啦，导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，很大程度上决定我牛不牛...
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如何快速查找物种间对应的同源基因有时候，大家做实验以小鼠为模型，但希望查看与之对应的人同源基因。像这种情况，我们可以不需要进行序列比对来查找，因为比较麻烦。使用公共数据可能更高效。 1.基于NCBI Hom...
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Fst的计算原理与实战
概念回顾 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化程度，取值从0到1，为0则认为...
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生物信息常用工具和网站最近接二连三带了不少实习生和轮转生，可以预见后面几年实验室再有实习或者轮转的十有八九应该都是我带。这一篇列举一些生物信息部分常用工具和几个神奇网站。基本上每个工具都给出一两句...
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2开始陆续更新，文章已经投发到biorkix上，在网上搜了一圈，关于Orthofinder的使用的中文教程几乎是空白的，这周就借此机会和大家一起来学...
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「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析谈论到直系同源基因分析的时候，大部分教程都是介绍OrthoMCL，这是2003年发表的一个工具，目前的引用次数已经达到了3000多，但这个软件似乎在2013年之后就不在更新，...
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基因家族分析 | 预测基因家族收缩与扩张（orthofinder，cafe）
以下参照 hoptop的「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析这篇帖子试跑了一遍 1.软件安装 2.数据准备 下载「基因组学」使用OrthoFinder进...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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「基因组学」使用CAFE进行基因家族扩张收缩分析环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder，然后再安装CAFE 数据准备: 一共会分析mouse, r...
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生信基础知识复习之测序刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识，总能从不同角度获取一些观点，然后扩增自己的知识库，这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪，把自己认为重要的内容梳理下，用Q...
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全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因组重测序是通过对已有参考序列（...
