博士生，生物信息学专业
发简信
IP属地：湖北
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Seurat4.0系列教程9：差异表达检测
为了演示目的，我们使用通过SeuratData[https://github.com/satijalab/seurat-data]包提供的 2，700个 PBMC 。） 加载...
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测序了，然后呢（四）有了OrgDb才能进行富集分析刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类，OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系，以及基因与G...
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蛋白组分析---用Persues进行后续分析1. 上文中，我们用Maxquant软件分析了.raw数据，最终得到了个txt命名的文件，长这样： 2. 接下来，我们下载并打开Persues软件： 3. 我们导入刚刚的文件...
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蛋白组DIA分析：Spectronaut软件使用指南官方文档： https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准备 Spectronaut软件是蛋白组DIA...
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【3】蛋白质组学鉴定软件之Mascot1.简介 Mascot是非常经典的蛋白鉴定软件，被Frost & Sullivan形容为“质谱数据检索的黄金标准”，更新维护速度也很快（已发布到2.7版New feature...
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有相关性就有因果关系吗，教你玩转孟德尔随机化分析（mendelian randomization ）
流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路，比如缺乏元素A与某种癌症相关，那么我们可以通过补充元素A来减少患癌率。这个结论的大前...
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TwoSampleMR 遇到的坑
第一次尝试医学统计常用的MR，我选择了比较多用的R包，TwoSampleMR, 这个包还有一个webApp -- MRbase.所有流程基本和网上可以搜到的一样，这里推荐这个...
