原作者： Claus O. Wilke翻译：王诗翔 2018-07-15 cowplot是ggplot2包的一个简单插件，它的目的是为ggplot2提供一个出版级别的主题，使...
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【r<-ggplot2】cowplot介绍 -
如何根据染色体坐标批量提取对应的DNA序列（bedtools）
这一篇小笔记是在我处理自己的数据的时候遇到的问题，经过查阅资料解决了，故记录下来。 比如现在：你需查找一段序列，比如说小鼠的chr10:105280000-105280550...
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全解TOmicsVis完美应用于转录组可视化R包1. TOmicsVis R包简介 TOmicsVis v1.2.2Title: Transcriptomics VisualizationWebsite:https://b...
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差异表达分析——DEseq2差异基因筛选的常见方法有edgeR, DEseq2, EBseq等，这篇文章主要介绍DEseq2。 官方网站：https://bioconductor.org/package...
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GSEA富集分析+R分析+多类美化工具相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247507922&id...
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非约束排序2 主成分分析（PCA）第五章第五章 非约束排序2 主成分分析（PCA） 今天我们来学习一下赖江山老师的《数量生态学：R语言的应用 第二版》第五章的正式内容了，今天主要讲的是主成分分析，也叫主分量分析，内...
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看完这篇推送的，据说都学会了分化时间计算？！分子钟假说 基因序列中密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例相互替换，即具有恒定的演化速率，两个物种之间的遗传距离将与物种的分化时间成正比。我们通常采用单拷贝基因家族中的四重简...
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【比较基因组】从进化树到分化时间虽然不是学生物或者医学的，但是听了很多生命科学的报告。关于生命的起源、进化——从个体到宇宙，生命是如何从无到有，又如何实现了现在的千姿百态——是生命科学数百年来一直在研究的问...
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KaKs_Calculator2.0+ParaAT计算两个物种间的Ka/Ks
1.软件安装 ⭐KaKs_Calculator2.0⭐ParaATKaKs_Calculator2.0[https://sourceforge.net/projects/ka...
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根据基因组以及gff3文件提取4dtv位点
现在很多文章都关注4dtv位点，小编接下来分享下根据基因组以及gff3提取所有基因的4dtv位点的perl脚本： 运行程序： 注：该脚本小编不知道来源几何，虽在此分享，若有侵...
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「群体遗传学实战」第一课: 对SNP位点进行注释我们用于实战的数据集来自于2019年发表于NG的西瓜文章，它提供了GATK过滤后的SNP数据集用于分析，并且附录提供了完整的样本信息。该SNP数据集包括414个西瓜，2000...
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「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA图主成分分析(PCA)是一种线性降维方法，能从纷繁复杂的数据中抽离出关键因素，用来区分不同的样本。这里我们不谈PCA背后的数学原理，只谈哪些软件能够处理数据，我找到了以下三款 ...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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在脚本里面调用conda创建的环境
事情源于，我在写脚本的时候，在脚本里面插入了一句 conda activate 环境名, 然后出现如下的报错提示 conda认为我没有初始化环境，我脚本是在bash环境下运行...
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新手的R包安装指南：一条命令就可以把任何来源的R包安装上啦
太长不看版 只需要使用BiocManager::install()就可以把CRAN、bioconductor、GitHub来源的包都安装上了。 R包安装的天下三分 安装R包是...
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「摸鱼快报010」一个基于低覆盖度的全基因组测序的群体遗传学数据分析教程摸鱼快报是一档致力于轻量化地收集优质生物信息学及相关领域资料带给大家的小栏目, 力求废话不多, 干货为王. 项目地址:https://github.com/nt246/lcw...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
个人介绍
惜霜蟾照夜云天。
朦胧影、画勾阑。
人情纵似长情月，算一年年。
又能得、几番圆。
欲寄西江题叶字，流不到、五亭前。
东池始有荷新绿，尚小如钱。
问何日藕、几时莲。
朦胧影、画勾阑。
人情纵似长情月，算一年年。
又能得、几番圆。
欲寄西江题叶字，流不到、五亭前。
东池始有荷新绿，尚小如钱。
问何日藕、几时莲。