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    SNP过滤时常用参数的解析(群体遗传)

    关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生物学问题的解释;第二,群体研究时,由于测序的个体较多检测出来...

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    三元图总结

    简介 三元图(Ternary plot)1是描述三个变量之和为常数的质心图,其核心原理是: 等边三角形内任意一点到三角形三边的距离之和等于其中一边上的高(常数); 过等边三角...

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    GWAS分析-曼哈顿图 (二)

    上次给大家简单分享了GWAS分析一些简单术语及相关事件(https://www.jianshu.com/p/67e1878845e3[https://www.jianshu....

  • 9.2 GWAS:关联分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件,还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估,功能非常强大,要说缺点,可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍,这...