请问一下结果第三列测序到的reads数目均为0是不是说明我前面质控比对时出现了问题呀
2022-10-10 samtools分析测序基因组的depth和coverage对基因组测序完成后,我们经常需要统计测序深度(depth)和对基因组的覆盖率(coverage) 这两个概念有时候不太好区分,有时coverage也表示测序深度x. 我们用s...
请问一下结果第三列测序到的reads数目均为0是不是说明我前面质控比对时出现了问题呀
2022-10-10 samtools分析测序基因组的depth和coverage对基因组测序完成后,我们经常需要统计测序深度(depth)和对基因组的覆盖率(coverage) 这两个概念有时候不太好区分,有时coverage也表示测序深度x. 我们用s...
一、简介 Samtools是一个用于操作sam和bam格式文件的应用程序集合,具有众多的功能。 它从SAM(序列比对/映射)格式导入和导出,进行排序,合并和索引,并允许快速检...
Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段(短读 short reads)“覆盖”的强度有多大? 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
1 相关概念 测序深度(sequencing depth)=测得碱基数/reference碱基数,结果是n就是nX 覆盖度(coverage, breadth of cove...
一、工作原理 新型纳米孔测序法(nanopore sequencing);采用电泳技术。 Nanopore测序当中的核心部件是这个由蛋白质构成的纳米级的小孔,我...
文/雪忧 2018-12-13 我的舍友不努力,我身边的人却在努力。 我的大学就是温水煮青蛙,我就是懒惰的河草。 我的好朋友也在努力,我也不能再颓废下去。 我的梦想不能就此熄...
文|少女小渔 从学生时代,就总爱买书,前几天某卫视翻拍《凉生,我们可不可以不忧伤》,一下子让我想起高中那个时候,因为钱不够,所以和闺蜜凑钱买这套书,我买一、三,她买二、四。 ...
2018年还剩下最后的三周 有一句话不知道你听过没,说的是:“所有年底眼睛里的泪,都是年初脑子里进的水。” 所以,问题出在哪儿呢? 是不是年初的目标设定有问题? 还是一年中执...
上一篇文章,就简简单单写了我对《洋葱阅读法》的一些简单感受,书中提到很有用的各种阅读方法技巧,我都没有详细说明,而这篇就介绍下这本书到底有什么值得我们可以借鉴的阅读方法。这些...
本月将第二次参加明月同学的行动力训练营,作为一个复训生,凭借着模糊的记忆和重复学习,在开课前先做一个复训笔记。读书是学习的基础,认知的门户,那么怎样快速读一本书,并做完有效的...