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20天学会Python！Python编程基础+Python编程高阶+Python编程实战（附赠PDF）零基础学编程，用Python入门是个不错的选择，今天整理了Python从入门到精通的书籍 该文档全面、系统、深入地讲解了Python编程基础语法与高级应用。在讲解过程中，通过...
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shell脚本从入门到实战
[TOC] Shell 是一个用 C 语言编写的程序，它是用户使用 Linux 的桥梁。Shell 既是一种命令语言，又是一种程序设计语言。 Shell 环境Shell 编程...
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跟着Genes|Genomes|Genetics学数据分析：R语言edgeR包做转录组差异表达分析论文 Sex-Specific Co-expression Networks and Sex-Biased Gene Expression in the Salmonid B...
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<总结向> awk使用手册
awk 用于文本文件的分析与处理 0x00 使用方法 awk '{pattern + action}' [filenames] 其中pattern代表的是正则表达式，用于匹配...
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甲基化倍性问题新思路问题的由来 DNA methylation has diferent methylation patterns in alleles，对于等位基因来说，对于二倍体生物来说，一...
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【免费工具】3分钟搞定GO/KEGG富集分析在进行差异基因表达分析时，得到显著差异基因后，接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能，常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析，今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAV...
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RNA-seq入门实战（六）：GO、KEGG富集分析与enrichplot超全可视化攻略本节概览：1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG与GO富集4.用enrichp...
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GO、KEGG富集分析——DAVID与KOBAS在线分析工具在进行差异基因表达分析时，得到显著差异基因后，接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能，常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析，今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAV...
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2022-03-13 GO和KEGG分析（一）---根据韦恩图交集的基因进行分析针对某个基因敲除的斑马鱼，在12-25天会逐渐死亡，因此我们选择了8dpf 和16dpf 的由于进行转录组测序，根据差异基因我们绘制了如下的韦恩图，然后我们需要重点关注灰色区...
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R语言：clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换
一、读取文件，ID转换 1.读取文件 2.ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对clusterProfiler） ID转换用到的是bitr()函数，bi...
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RNA-seq(9):功能富集分析这部分开始进行基本的富集分析，两类 A：差异基因富集分析（不需要表达值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不管有无差异，需要全部genes...
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分析记录 | 差异分析和KEGG GO物种Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差异分析 只有count数据。按照count数据建立col data表格。 因为col data表格只...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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2022-03-24利用BatMeth2分析甲基化数据
详细参考路径为：https://www.dna-asmdb.com/tools/batmeth2-tutorial/bt2-pipeline.html https://bat...
