<del>一天一篇……</del>慢慢来
IP属地：新疆
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GATK4 多个样本GenotypeGVCFs前用 CombineGVCFs还是GenomicsDBImport
我们知道，GATK 4 多个样本joint genotyping用模块GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三种形式的输入文件：1）a sin...
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生信小白学习系列：使用MaSuRCA对拟南芥进行组装的实战训练(2)
继上一次内容讲完组装的基本知识后，大家对其理论知识都有了一定程度的了解。当然，如果你还没有阅读或者忘记了上一讲的内容，请不要犹豫先点开一下连接，先进行回顾一番： 这周开始会给...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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本小推车专门推各种perl相关的基本语法介绍，资源，应用。特别是与生物信息学应用相关的文章。 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 🐫 perl基本语法，比如和python语法的区别 🐫 perl上下文，比如将列表赋值给标量会发生什么 🐫 perl特殊变量，比如$_ $/ $\ 🐫 perl入门，比如循环，常见的正则使用等 🐫 perl进阶，比如引用，比如map grep等 🐫 perl高级，比如命名空间，继承，闭包等 🐫 perl的单行程序，比如与linux的各个工具搭配 🐫 perl常用模块，比如File::Basename Yaml 🐫 perl绘图，比如svg模块，GD模块，circos工具等等 🐫 perl与生物信息学之间的关系，比如用perl提取genbank 🐫 perl6的相关用法（生信不太建议学perl6） 备注：本文很多的文章也可在 JSON_NULL 的专题 『码神之路：perl篇』 中找到。这个专题对我的帮助很大，感谢这位简友
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。 内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习
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Python 零基础入门资料整理（更新版）
本文在喵在野的Python零基础入门资料整理基础上补充整理而成，主要增加了周刊、对语言初步感受、还有论坛的三个部分的内容。 安装Python 编写保存程序的工具：Notepa...
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Pythoner的集中营, 收集关于Python的各种知识教程. 推荐文章和系列阅读: 1. Python 零基础入门资料整理（更新版） http://www.jianshu.com/p/9c02dade7e90 2. Python 零基础入门资料整理 http://www.jianshu.com/p/5eee782b8627 3. Python 从入门到高手系列视频教程 http://www.jianshu.com/p/93085280e4a4 4. Python学习网络资源整理 http://www.jianshu.com/p/fe0e5a515696 5. Python爬虫学习系列专题 http://www.jianshu.com/notebooks/255245/latest 6. Python Django博客开发专题 http://www.jianshu.com/notebooks/293635/latest PS: 另招Python热心管理员
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收集一些R语言相关的报错和解决方案。如果有些问题你无法处理，欢迎整理问题发送到xuzhougeng@163.com
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
