最近在做蛋白与小分子复合物的动力学模拟，学习了Gromacs的用法，以此记录一下。这里贴出Gromacs的官方文档http://www.mdtutorials.com/gmx...
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Gromacs-蛋白小分子复合物分子动力学模拟实战（包括软件安装） -
Prognostic potential of PRPF3 in hepatocellular carcinoma本文选自AGING，喜欢的也别下载阅读了。就是一个字，特没劲。 兄弟们，我又来整活了。介绍一个单基因研究的生信分析。 PRPF3这个玩意儿在多种肿瘤中的作用不言而喻，那么在肝...
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解忧小工具｜让HPA验证你的结论，生信文章好帮手大家在阅读文献的时候，有没有发现，一些偏生信分析的文章，研究方法里没有写免疫组化的相关实验材料及信息，结果里却又有很好的免疫组化蛋白验证，作者通过免疫组化实验验证蛋白的表达水...
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医学博士需要掌握的10万个为什么之1---什么是WGCNA 分析
WGCNA 分析 基本概念 WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中...
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MultiQC软件的安装运行及对数据质量做出评价一.conda安装multiqc软件 1.安装conda 2.安装python2环境 3.用conda安装multiqc软件 4.查看multiqc是否安装成功 multiq...
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miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】该教程分为2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 因为之前碰到...
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主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南 后台很多同学私信想学习一下主成分分析(PCA),今天就简单写一下。之后有看到文章再实战复现。 主成分分析（PCA）是一种将数据降维技...
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主成分分析（PCA）& 主坐标分析（PCoA）——R包绘图（2D/3D散点图）导读 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始...
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[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA）本期内容为[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据分析方法。...
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主成分分析-PCA图的优化（R语言）
R语言的主成分分析（PCA）详解和带聚类的PCA图绘制 最近有个老师在整理文章数据，由于分组较多，想展示PCA图，说明不同分组的差异，公司默认给出的PCA图比较朴素，想做的好...
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【数据降维与聚类】 之 主成分分析（PCA）及可视化 “全网最详细！！”教程
首先，必须说明，PCA总体来说是主观的，二维不行的时候上三维。 那么先简单看一下PCA是什么 PCA是使用最广泛的数据降维算法之一，利用降维思想，把多个指标转换成少数几个综合...
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R语言绘图 | 两组或多组GO/KEGG富集结果气泡图原文链接：两组或多组GO/KEGG富集结果气泡图绘制(点击链接)[https://mp.weixin.qq.com/s/MDGhpZKvrj9shfS6XtvX9Q] 复现图...
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WGCNA文档使用教程本文是对WGCNA英文说明文档的翻译，英文的请查看这里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...
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转录组数据分析—DEseq2差异分析转录组测序的目的之一，就是探索组间显著表达变化的基因——差异表达基因。那么，如何基于转录组测序获得的定量表达值，识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子呢？DESeq2是...
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RECORD MY GRADUATION THESIS: 生态环境中的小可爱_枝角类_201905于狮子山-3第三章 隆线溞不同生殖个体间RNA-seq与miRNA-seq分析 3.1 前言 隆线溞（Daphnia carinata）隶属节肢动物门（Arthropoda）、甲壳纲（C...
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一文讲完叶绿体基因组比较分析的全部软件和配套ggplot绘图脚本前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教程之零散，各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此，列出个人...
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BLAST（2.12.0+）使用记录文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279684/#appendic...
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