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周转（repl）和嵌套（nest）对β多样性贡献的分解
Sørensen 指数和 Jaccard 指数作为配对样方间β 多样性的度量，使用 Baselga 在 2010 和 2012 年提出的 β 多样性分解方法结合 Legend...
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不做无条件咨询，见谅
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16S测序分析（三）用LEfSe寻找组间差异细菌导读 前面已经介绍了获取菌属相对丰度表的方法，以及多样性分析中的基本概念和计算方法。接下来将开始介绍一种寻找组间差异细菌的常用方法LEfSe。LEfSe（Linear dis...
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R语言绘图之plot()函数的使用可以绘图的语言很多，各种语言各有千秋，前面我们使用了R语言内置的数据集进行了入门级但是又特别简单有趣的绘图，今天我们就针对折线图和散点图为大家仔细讲解一下，如要了解更多，可取...
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中农在读博士，欢迎关注个人公号【BioparaMeta】一起学习、交流
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R语言-使用ggplot2绘制物种丰度堆叠柱状图本文使用某宏基因组测序数据中的种水平类群丰度表，并直接根据所有种相对丰度总和，提取出top10丰度的种类群，作图展示这些种的丰度组成，top10外的类群合并为“Others”...
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请问data3中others的相对丰度值是负值是为什么呀
绘制堆叠柱形图（ggplot 2）使用群落微生物物种丰度表数据
群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图（ggplot 2） 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制堆叠柱形图来展示不同样品中优势菌的相对多度。 话不多说，直接...
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使用ggplot2绘制菌群组成堆叠图堆叠图主要看不同菌群在该样本中的相对比例，把每个样本的情况或者每个处理组的情况展示出来，可以大致看出样本的重复性好坏和不同处理间的某些菌群变化趋势。 1.门水平的堆叠图 2....
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R语言_ggplot2绘图ggplot2语法 入门级绘图模版属性设置分面几何对象统计变换位置调整坐标系 以上是各种参数，需要的时候用一下就可以。 1.入门级绘图模板 ggplot(data = )+...
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R语言调色R中的颜色 R提供了657个颜色名字，还有rbg()函数来自定义颜色，在cairo_pdf中还支持透明度调节 R提供了许多调色板，可以查看默认调色板palette()，也可以...
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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R语言可视化及作图3--图形颜色选取R语言绘图系列： R语言可视化及作图1--基础绘图（par函数，散点图，盒形图，条形图，直方图）[https://www.jianshu.com/p/9bb8810df75a...
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昆虫学博士，分享实验Protocol、生物信息、科研绘图、中国传统术数学等。
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R语言配色方案: Colors in R前言：巧妙的色彩搭配，能够绘制出更具审美价值的图片，令人耳目一新。本文主要讲解比较受欢迎的R包配色方案。 （一）：RColorBrewer 包 调色板有3种类型：连续型调色板...
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R语言ggplot2作图好玩的配色包~宫崎骏动画配色R包的github主页 https://github.com/ewenme/ghibli[https://github.com/ewenme/ghibli] github主页...
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R语言ggplot2作图配色相关R包R语言ggplot2作图的时候配色如果不知道如何选择，可以参考如下链接https://r-charts.com/color-palettes/ 这里分别提供了连续型数据和离散...
