转录组分析中基因的GO富集分析这步有很多软件可以选择，这次我们来介绍下如何利用Cytoscape软件中的一个简单又好用的Bingo小插件完成富集的工作，Cytoscape其实...
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Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 -
DNA甲基化数据分析全流程
2021-01-01 更新 简单记录一下平时的分析过程 和RNA-seq前期流程类似 -- 质控、去接头、比对参考基因组、排序 后期就是要提取甲基化位点，包括CpG、CHG、...
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进化树+蛋白结构域目标 数据准备 依然查看help界面的Protein domains 在上传数据的时候我们发现多了按钮，可以从PFAM上上传数据，evolview使用的标签名必须与PFAM的...
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驻地氧气瓶，一个软件分享者，专注于影视、音乐、小说动漫、磁力链接等软件破解，老司机必备。<br>关注微信公众号：驻地氧气瓶，送你一份福利大礼包。
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知乎推荐10个黑科技网站，相信你在朋友面前会一鸣惊人大家好，我是小瓶子，一个软件资源分享者。今天给大家推荐是一些提高生活质量和效率的网站，相信我，看完你肯定会有收获！ 1、思谷搜（https://siguso.com） 这是一...
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系统进化树的构建一、多物种某基因家族的氨基酸序列fasta文件的准备（此例为yth基因家族） 1.已鉴定物种的某基因家族文件的获取 HMM文件准备 查找pfam号如何查找基因家族pfam号：...
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让你的Linux终端变得酷起来对于经常使用Linux系统[https://linux265.com/distro/]的人，在Linux系统终端上实现特效是一件非常炫酷的事情。 今天我为大家推荐三款可以让你...
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利用ggplot2进行数据可视化2020-04-25 1.1. first step --意识到ggplot绘制其实是由一层层图层组成，一个命令即可增加一层 ggplot(data = mpg) + geo...
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ggtree绘制进化树绘制进化树的方法有很多，入门的MEGA，iTOL，evolview等，但是没有一个如ggtree这般高效简单，轻轻松松绘制高端进化树，废话不多说，直接看代码喜欢的小伙伴可以关...
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公众号 R语言数据分析指南，欢迎大家关注
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学好统计，我10分钟就完成了别人服务器通宵才完成的分析果子老师做过一个非常惊人的举动，用DESeq2处理1225例样本的TCGA数据，在没有使用DESeq多线程参数parallel的情况下，跑了将近40个小时。 那么问题来了，在...
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RNAseq004 转录组入门(4)：参考基因组下载1 参考基因组 以下内容主要参考jimmy大佬的生信技能树及生信菜鸟团公众号 1.1 【直播】我的基因组（五）:测试数据及参考基因组的准备 这个对新手来说，是一个很大的坑，h...
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第二天多套GEO数据集联合分析流程
网页小工具：shinyGEO：零编程基础分析GEO数据 https://mp.weixin.qq.com/s/UYI61Rl0Jf5LPe3MxjXyAA（网速太渣 明天继续...
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典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化GEO是当今最大、最全的公共基因数据资源库，包括基因的表达、突变、修饰等信息，涵盖几乎所有的疾病，且单个实验检测样品数目较多，是我们分析、学习的很好资源。 实验设计 原始文章...
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GEO数据分析[笔记]导读 个人笔记，初次分析芯片数据，纯属练习，不涉及生物学意义。 一、数据获取 1 GEO官网中输入GSE编号，检索 2 获取分组信息，下载丰度表矩阵、平台探针信息等数据 3 ...
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scanpy分析单细胞数据R在读取和处理数据的过程中会将所有的变量和占用都储存在RAM当中，这样一来，对于海量的单细胞RNA-seq数据（尤其是超过250k的细胞量），即使在服务器当中运行，Seura...
