对于基因的差异表达谱,常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多,热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因(比方说p值最显著的那些),在图中...
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对于基因的差异表达谱,常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多,热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因(比方说p值最显著的那些),在图中...
请一定看这里:写下来只是为了记录一些自己的实践,当然如果能对你有所帮助那就更好了,欢迎大家和我交流 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization):D...
今天发现了一个超有用的R包参考:比较TCGA正常组织与肿瘤组织表达量不能更方便 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0e...
在简书上看了很多文章,有很多收获,但自己从来没写过。 生信有很久没碰了,因为需要,又一次捡了起来。 之前在TCGA数据库一直没有找到骨肉瘤的临床数据,不能把基因表达和临床预后...
Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析 [TOC] Question 有朋友在后台提问:在使用clusterProfiler做富集...
Construction of a solid Cox model for AML patients based on multiomics bioinformatic an...
在儿童肿瘤中,白血病是最常见的恶性肿瘤,其中15%~20%的儿童白血病属于急性髓系白血病(AML),且患者预后较差。目前,基于NGS技术的基因组图谱已经阐明了儿童AML的基因...
作者:白介素2 UCSC xena数据存储中心总览 UCSC xena的数据 存储仓库主要包括的数据有以下这些: TCGA hub Pan-Cancer Atlas Hub ...
老师,我的第12行运行不出来,一直报错“-f”
生信-使用R语言将gdc数据转化为基因表达矩阵从gdc-client下载数据后,接下来,我们可以尝试把gdc数据转化为基因表达矩阵,这里需要对原始数据文件进行加工处理 1.准备工作 创建一个工作目录,将样本文件夹放在al...
从gdc-client下载数据后,接下来,我们可以尝试把gdc数据转化为基因表达矩阵,这里需要对原始数据文件进行加工处理 1.准备工作 创建一个工作目录,将样本文件夹放在al...