不断学习，不断忘记，不断回顾，不断进步，这便是凡人的学习方式,或谓曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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T 细胞组库分析及多样性和克隆性度量最近在做免疫组库相关的东西,一边看，一边简单翻译一波，也是方便自己回顾，一遍简单吐槽，丢在自己的笔记本里面也没啥意思，有错误的就不管了，可以自己看原文 这是一篇综述，主要讲述...
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单细胞新药研发导论|| 药靶发现开刊词||单细胞新药研发导论[https://www.jianshu.com/p/0008cc51ad86]单细胞新药研发导论|| 新药研发管线[https://www.ji...
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SCENIC是干啥的？
SCENIC是干啥的？ 【输入】motif数据库、单细胞RNA-seq数据 【输出】regulons、每个细胞的regulon activity scores (RAS) 【...
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单细胞36计之32---单细胞进行GSEA分析32、第三十二计 空城计在敌众我寡的情况下，缺乏兵备而故意示意人以不设兵备，造成敌方错觉，从而惊退敌军之事。后泛指掩饰自己力量空虚、迷惑对方的策略。
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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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单细胞分析实录(6): 去除批次效应/整合数据
上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样，有些是可以聚到一起的亚群，却出现了不同样本分开/偏移的情况，比...
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单细胞免疫组库数据分析||Seurat整合单细胞转录组与VDJ数据在做10X单细胞免疫组库分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘转录组，那么怎样才能把两者结合到一起呢？ 今天我们尝试用我们的趁手工具做一下整合分析。 首先是下载数据...
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scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，在发育相关研究中使用频...
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单细胞轨迹推断（Trajectory inference）分析（详细代码）练习需要的数据在这里下载：https://github.com/NBISweden/excelerate-scRNAseq/blob/master/session-traje...
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基于Seurat v3 object 从头构建 monocle的 CDS
文章转自作者：阿糖胞苷链接：https://www.jianshu.com/p/41372e039194来源：简书简书著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者获得授权并注...
