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  • @byemax 感谢,请问对于树文件,如何判定物种树,还是基因树更好呢?

    选择压力分析,从序列下载到结果绘图

    选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率(Ks)之间的比例。 一般认为,同义...

  • 你好,请问(1)“python3 callCodeml.py 序列文件夹 物种发育树文件”中物种发育树是指的利用所有单拷贝基因串联后构建的树吗?(2)序列文件夹里包含的就是所有单拷贝同源基因独立的fasta文件?

    选择压力分析,从序列下载到结果绘图

    选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率(Ks)之间的比例。 一般认为,同义...