哆啦A康

有个别序列实在调整不出终止密码子是否能直接以T或TA结尾呢？但是其长度就不是3的倍数了

利用Geneious对叶绿体基因组进行注释及查看

使用软件：Geneious目的：对组装好的叶绿体基因组进行注释，注释好后进行查看，无误后绘制圈图 【注释部分】 1.首先从NCBI上下载一段与要注释的物种（目标序列）同源的物...

恭弥家的凤梨君

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哆啦A康

你好用PhyloSuite做线粒体基因组蛋白编码序列比对时，总是显示有终止密码子，不知道怎么样彻底清除序列里的终止密码子？

选择压力分析，从序列下载到结果绘图

选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks）之间的比例。 一般认为，同义...

byemax

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哆啦A康

我用mega7比对几个物种的线粒体蛋白编码序列时总显示有终止密码子，不知道是什么原因？自己手动删除还是会报错，如何才能彻底去除呢？序列都是从NCBI上下载的coding sequence

paml计算dn/ds的小实例

更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的计算，自己尝试了分支模型和位点模型的计算，简直不要太容易！ 更新：20190314 教程 http://wiki...

小明的数据分析笔记本

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哆啦A康

你好，在做序列的前期准备时，发现线粒体蛋白编码序列用mega比对总是显示有终止密码子，明显的TAA都删除了还是会显示，不知道如何有效去除线粒体蛋白编码序列的终止密码子呢？

选择压力（dn/ds）计算

dn/ds又叫ka/ks，具体的概念，意义百度上都有。现主要介绍最近用到的三种计算途径，分别是maga7，datamonkey，paml。 做选择压力分析的序列文件，需要先c...

Cady_duan

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