发简信
IP属地：山西
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ASV和OTU有什么不同？哪个更好？遇到了一个16S的课题，于是开始认真学习ASV和OTU的差别，顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物组领域最常见的研究手段。尽管鸟枪法测序可以为我们提供更高分辨...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从OTU table到marker物种笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程。可以使用usear...
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【备份】youtube-dl使用介绍去年12月18日，那篇介绍youtube-dl的文章突然被封，修改申诉未得到任何回复。下面是后台的备份。 下载安装所需软件 Step1 下载与安装Python 1.访问Pyt...
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Smart is the new Sexy
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释请一定看这里：写下来只是为了记录一些自己的实践，当然如果能对你有所帮助那就更好了，欢迎大家和我交流 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization)：D...
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RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
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多多分享。
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组间差异检验，终于有人讲清楚了!什么是组间差异检验？就是组间的差异分析以及显著性检验，应用统计学上的假设检验方法，检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲，所有的差异检验都基于一个假设：组间没有差异，变量之...
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R语言基础-数据的导入与导出
数据的导入 参考文章 在R语言中，常常用到导入数据的源文件是Excel文件，CSV文件，文本文件等等。 导入csv文件 此方法可以用以导入Excel数据，将Excel数据转化...
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再读《数量生态学：R语言应用》我喜欢在海边捡贝壳，我喜欢在草原上追逐群羊，我喜欢数天上的星星。我好奇，只有七秒记忆的鱼，如何找到回家的路。每个人都是天然的生态学家，有着对身边事物多样性以及其中蕴含的数量与...
