β多样性 β多样性：指沿环境梯度不同生境群落之间物种组成的相异性，也被称为生境间的多样性（between-habitat diversity），是对不同样品的微生物群落的构成...
IP属地：江西
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宏基因组测序分析（五）β多样性分析 -
宏基因组测序分析（四）α多样性分析多样性分析 群落多样性主要指群落中所包含的物种数目和物种个体数的分布特征。主要包含： 物种丰富度，species richness：群落中物种数目的多少 物种均匀度，spec...
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宏基因组测序分析（三）物种组成及丰度估计基于测序数据，使用 kraken2 进行 reads 的物种注释，使用 braken进行丰度估计，之后基于丰度进行物种多样性分析及差异物种分析。 数据库构建 运行 krake...
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宏基因组测序分析（二）测序数据质控过滤
二代宏基因组测序数据的质控和过滤。 测序数据质量过滤，包括测序质量、adapter 等过滤 去除污染数据，一般是宿主数据。该步骤对于水体、土壤等样品可以跳过 数据质控 原始测...
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宏基因组测序分析（九）基因预测及去冗余由于原核生物编码基因不包含内含子，由连续的编码区构成开放阅读框（ORF），编码区具有容易辨别的序列特征，基因预测准确性较高。 prokka 和 metaGeneMark 均为...
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