Prokka 的使用 Prokka可以对原核基因组和宏基因组进行快速的功能注释。 参考资料: http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1...
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Prokka 的使用 Prokka可以对原核基因组和宏基因组进行快速的功能注释。 参考资料: http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1...
熊金波实验室出品 整理归纳:Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下: 地址:gs0.genek.tv 用户名:u3276 密码:genek.tv(建议...
背景 宏基因组组装,即把短的reads拼装成连续的序列contig,再根据PE等关系将contig拼装成scaffold。与单个基因组组装不同,宏基因组组装最终得到的是环境样...
文献信息: 标题:Large-Scale Metagenome Assembly Reveals Novel Animal-Associated Microbial Geno...
导读 宏基因组分箱(Binning)是将宏基因组测序得到的混合了不同生物的序列或序列组装得到的contigs按物种分开归类的过程,类似下图[1]。传统的单物种全基因组序列都是...
导读 这篇文章仅仅纳入了8个检测对象,但是作者用这屈指可数的样本不仅分析了冷冻、乙醇、RNAlater三种保存方法对标本的微生物群组成、宏基因组和宏转录组的影响,还分析了口腔...
宏基因组(metagenomics) 宏基因组学(Metagenomics)也称为元基因组学,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。自然界中约有99%的微生物是不能在...
ggcor包最初是因为能快速实现19年Science一组合相关性图(上图所示)变得流行起来,除此该包对热图、热图等等的可视化都是很方便快捷的,除了之前介绍过的几种相关性图几种...