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    2019-02-16细菌基因组SNP calling

    选择一个合适的参考基因组,最好是NCBI公布的参考基因组,如Escherichia coli 选择CFT073菌株。使用bwa index建立索引 2.使用bwa mem ...

  • 老师,后续细菌的突变注释用什么软件呀

    2019-02-16细菌基因组SNP calling

    选择一个合适的参考基因组,最好是NCBI公布的参考基因组,如Escherichia coli 选择CFT073菌株。使用bwa index建立索引 2.使用bwa mem ...

  • 老师,这里的rootage参数设置,在哪里能查到呀

    mcmctree估算物种分歧时间

    推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法(ML)构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...

  • 老师,rootage参数设置在哪里能查到呀

    mcmctree

    注:数据集是核酸序列; 1. fasta2paml; perl Gblocks2Paml.pl orthology.fa orthology.fa.paml 2. 配置spe...