2026版RNA-seq全流程教程 - 文集

本节概览本流程利用 RcisTarget 包，从差异表达基因出发，系统预测调控这些基因表达变化的关键转录因子（TF），并可视化 TF‑motif...

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本节概览：1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差异分析5.GSVA结果可视化：...

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在 RNA-seq 下游分析中，通常需要将上游处理得到的原始计数（counts）转换为标准化的表达量，如 FPKM、RPKM 或 TPM，以便消...

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本节概览1. WGCNA基本概念：定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行：⓪输入数据准备①判断数据质量，绘制样品的系统聚类树...

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本节概览：1. Cytoscape 软件基本介绍2. 数据导入：蛋白互作节点信息导入、其他注释信息的导入3. PPI网络图绘制：➀选取部分节点展...

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本节概览：1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用：①STRINGdb数据库导入 ②获取STRING_...

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本节概览：1.GSEA简单介绍2.创建GSEA分析所需的geneList，包含log2FoldChange和ENTREZID信息3.利用clus...

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本节概览：1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG...

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本节概览：1.DESeq2、 edgeR、limma的使用2.三类差异分析软件的结果比较——相关性、韦恩图3.选取差异基因绘制火山图和热图ps:...

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