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前面我们已经拿到了差异表达基因以及WGCNA与肿瘤最相关的两个模块里的基因,下面我们就从这些基因中找到文章标题中的那3个关键基因:AURKA, ...
接下来是对WGCNA分析的yellow模块和turquoise模块里的基因分别做GO和KEGG富集分析; 文章中是用R包clusterprofi...
找完差异基因后,现在开始这篇文章的WGCNA分析,这个分析最主要的是要得到与表型相关的基因; 先看看文章中怎么做的: 首先对数据进行过滤:过滤后...
前面我们处理了表达矩阵以及临床信息,下面开始做差异分析; 首先,我们看一下文章里是怎么做的: 这里让我比较疑惑的是取|logFC|>1的话,并不...
文章 AURKA, TOP2A and MELK are the key genes identified by WGCNA for the p...
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