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2023-07-24基因组功能注释与富集分析
软件安装 处理blast比对结果 tar tzf file.gz #查看压缩包的内容，不解压
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2023-08-18bwa批量比对
进到align目录对质量好的测序数据进行比对 一个个比对，生成BAM文件 align目录sample=SRR7696207 2或者循环批量比对方...
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2023-07-23 upload_to_NCBI
真核生物只需上传基因组序列文件，原核生物还需要上传注释文件
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2023-07-21 服务器外网连接技巧
首先要有公网的服务器ssh -f -N -R 52813:lcoalhost:22 train@chenlianfu.com[mailto:tr...
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2023-07-21使用Trinity进行转录组De novo组装(无参)软件安装与下载 运行数据 功能注释 组装后的文件就是转录本文件在未消除样品之间的差异之前，用TPM来比较勉强可以，但是FPKM不行。
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2023-07-21 IsoSeq3利用pacbio测序数据进行全长转录本序列分析
使用IsoSeq3利用pacbio测序数据进行全长转录本序列分析，为了得到更准确的基因注释作准备，但价格昂贵，且无法进行表达量分析
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2023-07-21 变异位点(snp,indel)检测-GATK，snpEff
软件安装 根据INDEL信息批量设计引物 SnpEff注释软件安装 如何去除indel位点？gatk如何统计某个变异位点频率？https://b...
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