得到高质量分箱以后，可以使用 GTDB-tk 对物种基于进化关系进行分类学注释。 GTDB 物种分类数据库 GTDB (Genome Taxon...

分箱结果可以使用 checkM 检查完整性和污染度。 checkM 基于数据库中构建好的单拷贝基因集和进化树，将bin定位到进化树中找到参考物种...

分箱-binning 宏基因组分箱是指从宏基因组数据中将不同物种的序列分离，将来自同一菌种的序列聚类，得到单个菌株的数据。分箱的对象可以是rea...

使用 DESeq2 进行差异基因分析，输入数据为 gene count 矩阵文件和样品分组信息表。 差异基因分析 输出结果：unigenens....

eggnog注释 使用在线版 eggnog-mapper 进行 eggnog 数据库注释。 eggnong数据库全称为evolutionary ...

由于原核生物编码基因不包含内含子，由连续的编码区构成开放阅读框（ORF），编码区具有容易辨别的序列特征，基因预测准确性较高。 prokka 和 ...

宏基因组组装 基因组组装，即把短的reads拼装成连续的序列（contig），再根据PE或者long reads等比对关系将contig拼接成s...