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【ATAC-Seq 实战】五、peaks、motif注释这里是佳奥！新的一年，ATAC-Seq的学习也进入了尾声。 让我们开始吧！ 1 peaks注释 统计peak在promoter，exon，int...
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【ATAC-Seq 实战】四、计算插入片段长度，FRiP，IDR值与deeptools可视化这里是佳奥！ 2022年的最后一天，让我们继续ATAC-Seq的学习！ 1 计算插入片段长度 非冗余非线粒体能够比对的fragment、比对率、...
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【ATAC-Seq 实战】三、比对与Peaks Calling这里是佳奥！我们继续clean数据的比对。 1 使用bowtie2进行比对 用bowtie2进行比对和统计比对率, 需要提前下载参考基因组然后使...
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【ATAC-Seq 实战】二、分析环境搭建及原始数据处理
这里是佳奥！ 让我们从配置环境开始吧！ 1 Linux环境 2 R环境 3 下载sra数据 组织好项目 批量下载 4 转化为fastq 5 fa...
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【ATAC-Seq 实战】一、分析流程
这里是佳奥！我们又开始了新的分析流程学习。 与ChIP-Seq相似，ATAC-Seq也是通过染色质片段来进行表观相关的分析。 我们先来看一下分析...
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