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scRNA-Seq | 多样本Seurat+CCA整合一、前言 左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起，不考虑去除批次效应，样本之间有明显的分离现象。右边的图是使用算法校正批次效应，不同的样本基...
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scRNA-Seq | 单细胞亚群合并与提取本文涉及：亚群合并，亚群提取，亚群细分，亚群抽样 一般来讲，不同亚群的细胞具有不同的功能，因此亚群分析对于研究十分重要，会影响后续分析结果。 进...
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scRNA-Seq | SCENIC 推断基因调控网络和细胞类型转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合 (TFBS/motif) ，调控D...
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scRNA-Seq | Seurat的三种单细胞数据整合方法汇总（批次校正）
适用背景 单细胞数据由于实验平台或样本等原因会造成不同数据集之间存在批次效应，这种批次效应是人为因素造成的，没有实际的生物学意义，可能对研究结果...
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scRNA-Seq | Seurat 打通单细胞常规流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjecet质...
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scRNA-Seq | Seurat 包原理解析seurat 涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神们分享的帖子，来梳理一下。 一...
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scRNA-Seq | Cell Ranger 定量Cell Ranger 是 10X Genomics为单细胞分析专门打造的分析软件，直接对10X的下机数据进行基因组比对、定量、生成单细胞矩阵、...
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单细胞转录组数据分析流程回顾一下：什么是单细胞转录组测序技术？ 细胞异质性是生物组织的普遍特征。由于传统的转录组测序(RNA-Seq)技术的测序水平是在个体或群体水平上...
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2022《Science》首个果蝇单细胞胚胎发育时间连续图谱问世IF=63.714推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：文章开发的果蝇胚胎图谱为后生动物生命周期中细胞状态的协调提供了信息，包含预测的核年龄将有助于探索基因在...
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