bulk RNA-Seq测序分析 - 文集

9篇文章 · 2502字 · 2人关注

bulk RNA-Seq（9）富集分析
欢迎关注Bioinfor 生信云！这一期我们来讲讲富集分析。构建OrgDB OrgDB是bioconductor中存储不同数据库基因ID之间...

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bulk RNA-Seq（8）差异表达分析可视化
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！上一期我们讲了样本相关性分析的一些可视化，这一期我们来做差异分析的热图和火山图。火山图火山图（...

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bulk RNA-Seq（7）样本相关性、聚类、PCA分析
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！读取三张表样本相关性相关性分析correlationR语言的cor函数，可以计算变量之间的相关...

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bulk RNA-Seq （6）数据挖掘的准备
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！我们做完了上游的基础分析之后，接下来就是数据挖掘了。我们先准备数据挖掘的三张表。表达矩阵（ge...

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bulk RNA-Seq （5）差异分析
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！差异表达分析用于比较两个样本中同一个基因的的表达量是否存在差异。用到的统计方法是假设检验，所以样...

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bulk RNA-Seq （4）合并表达矩阵
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！上一步定量，我们是对每一个样本进行的，现在需要将它合并到一个矩阵。这里通过一个脚本merge_t...

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bulk RNA-Seq （3）表达定量
欢迎关注Bioinfor 生信云微信公众号！上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的比对到参考基因组部分，接下来就是基因表达定量了。计算表达...

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bulk RNA-Seq （2）比对到参考基因组
欢迎关注Bioinfor 生信云！上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的数据清洗部分，接下来就是将清洗后的数据比对到参考基因组上（有参）。...

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bulk RNA-Seq (1) 数据清洗
欢迎关注bioinfor 生信云微信公众号！今天我们来讲一讲bulk转录组测序的数据清洗部分。 RNA-Seq是技术相对更成熟，应用最广泛，最...

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