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接前面的流程,我们使用FindIntegrationAnchors()[https://satijalab.org/seurat/referen...
前段时间跟师兄聊天,聊到seurat包,他说学软件一定要知道这个软件开发的目的,它是要解决哪些主要问题,哪些是次要问题,次要问题其他R包同样解决...
起因:最近有个问题样本,跑完cellranger,样本的cellranger结果如下,细胞数目极高(3W+)。在后续数据质控分析中,线粒体基因占...
一、seurat执行差异表达分析 根据单细胞数据预处理的方式不同(lognormalize和sctransform),执行差异表达分析代码有所不...
scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s415...
scWGCNA是一个生物信息学工作流程,是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coex...
1.R程序并行运算和调整R内部允许的对象大小的限制 默认是500 * 1024 ^ 2 = 500 Mb future在seurat的具体应用详...
1.如何通过Seurat对象获取细胞对应的坐标? 2.如何通过Seurat对象获取原始表达数据? 3.提取特定基因阳性表达的细胞? 4.修改ts...
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