14篇文章 · 16081字 · 5人关注
-
细胞通讯分析【二】——CellChat分析结果可视化本期内容同步发布于单细胞天地微信公众号。 回顾——细胞通讯网络构建 前面的帖子中我们已经成功地进行了细胞间通讯网络的构建，总的来看借助下面简易的...
-
细胞通讯分析【一】——CellChat上游分析本期内容已同步分享至单细胞天地 细胞通讯是指细胞与细胞之间的联系。细胞和人类一样，多细胞生物的很多细胞会相互作用，形成“细胞社会”，在这个社会里...
-
单细胞分析——如何确定合适的分辨率（resolution）水滴石穿，非一日之功 本期内容同时发布于单细胞天地微信公众号。 在进行单细胞分析时，非常重要的一步就是聚类分群，而在这个过程当中经常令人困惑的是...
-
小试牛刀——学会开Seurat函数“盲盒”
水有源，故其流不穷；木有根，故其生不穷。 长期以来，我们的单细胞分析仅仅停留在调包、套函数、……，这个过程会“蒙住”我们的眼睛，有些时候我们需要...
-
神兵利器——单细胞细胞类群基因marker鉴定新方法：genesorteR前面给大家介绍过神兵利器——单细胞细胞类群基因marker鉴定新方法：COSG[https://www.jianshu.com/p/bfcf90...
-
future——加速你的单细胞分析由于单细胞数据本身就具有数据量大的特点，所以在进行单细胞数据分析时往往会出现运行时间太长的问题。 不过好在 Seurat 为我们提供了部分函数与...
-
神兵利器——单细胞细胞类群基因marker鉴定新方法：COSG在单细胞数据分析当中，当我们聚类分群完成之后，紧接着就是细胞类型注释，细胞类型的注释就离不开 基因marker ，即在目标细胞类群和其它细胞类群...
-
单细胞分析踩坑实录：DotPlot()之'RNA' assay还是 'integrated' assay?前段时间在生信技能树单细胞学习小分队分享单细胞文章复现，一不小心就踩了一个坑……记录在这儿和大家一起分享。 背景 主要是想复现2020年发表在 ...
-
单细胞数据整合分析——批次效应（batch effect）去除在单细胞分析当中，经常会遇到整合分析的问题，即去除多样本数据之间的批次效应（batch effect），那么什么是批次效应呢？简而言之，批次效应...
文集作者
