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WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis,即加权基因共表达网络分析。它是一种分析多...
生存模型的构建方法包括:1. Lasso回归;2. Cox多因素回归;3. 随机森林;4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox...
1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析,它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考:生存分析之K...
1. clusterProfiler包,bitr()转换ID函数 clusterProfiler 是Y叔写的一个功能强大的R包,可以用来做各种富...
做差异分析需要的数据:表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了,因为其TCGA的样本ID比较特殊,样本ID的第14和15位是>=10还...
TCGA数据下载方法:gdc-client,Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息(样本):(存储单个病人表达数据,需整理为表...
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