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    Q:非肿瘤>>IC/BPS间质性膀胱炎?

    无意中看到一篇关于IC/BPS的非肿瘤文章,还有临床验证,非常值得模仿。 Title: Bruton tyrosine kinase (BTK)...

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    TCGA|一致性聚类

    一致性聚类基于重采样方法验证聚类的合理性,非常适合分子分型文章。下面就学起来。数据下载参考:R|TCGA|m6AlncRNA[https://w...

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    TCGA差异分析|2.DESeq2

    DESeq2真狠,TCGA-PRAD数据差异分析用了半个小时,而且还是多线程。这速度也没啥提升呀 声明:本文仅供学习交流用,禁止用于商业用途,如...

  • TCGA差异分析|1.非参数检验

    无意中翻到生信大神果子老师和洲更老师神仙大家的帖子,样本足够多时非参数检验就够用了(DESeq2可以先等等)。wx搜索:《学好统计,我10分钟就...

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    R| Agilent芯片分析-limma

    Aglient的芯片在科研界也是一大宠儿,通常根据其染色分为单通道和多通道两种。最为奇葩的是Aglient芯片的许多表达矩阵下载后发现有空值、负...

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    R|illumina芯片beads系列-lumi

    Illumina是常见的3大制造商之一,lumi包主要针对Illumina公司出品的bead系列表达谱和甲基化芯片进行质控、标准化,获得表达矩阵...

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    R|边距参数cheatsheet

    日常R语言学习搬运工,在可视化过程中,经常需要设置图片的空白间隔,这个时候经常是临时抱佛脚,刚好在网上看到一份很好的How big is you...

  • R|FPKM、RPKM差异分析

    芯片数据差异分析,常规用limma进行差异分析,而对于RNA-seq数据,常用edgeR、DEseq2和limma包数据分析,但数据数据必须是c...

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    R|Affymetrix芯片分析(2)-oligo

    对于更新版的Affymetrix芯片,如Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array,affy就显得无能为力了。这时候o...

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