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SV
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    SVIM-asm 基因组水平鉴定SV

    github:https://github.com/eldariont/svim-asm[https://github.com/eldarion...

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  • cuteSV鉴定SV

    一款用于鉴定三代长reads(HiFi, ONT, CLR)的软件。经作者检验,其准确度高于pbsv, svim, sniffles。 安装 简...

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    Paragraph对SV进行基因分型

    基于重测序数据用于对sv进行genotype. githup: https://github.com/Illumina/paragraph[ht...

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    SyRI鉴定SV

    Synteny and Rearrangement Identifier (Syri), 鉴定基因组间SV。以全基因组比对结果作为输入,可识别不...

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  • SURVIVOR 合并不同的SV

    SURVIVOR 用于模拟/评估 SV、合并和比较样本内及样本间 SV 的工具集。 githup: https://github.com/fri...

  • Delly 鉴定SV

    基于二代,鉴定,分型以及可视化,deleetions, tandem duplications, inversions and transloc...

    0.9 5708 1 13
  • manta 鉴定SV

    Manta Structural Variant Caller 详情:https://github.com/Illumina/manta[htt...

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    Assemblytics鉴定基因组间SV

    Assemblytics, 发表在Bioinformaticshttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/273182...

    1.9 3752 0 17
  • Svim 基于long reads鉴定SV

    SVIM 可基于long reads(pacbio, ONT,HIFI)进行call SV,deletion, insertion, inver...

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