scRNA with python - 文集

利用时间是一个极其高级的规律。——恩格斯单细胞转录组数据分析在阐述多细胞生物发育与疾病进程方面已经开发了多种新的方法，如比较有名的轨迹推断(T...

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在单细胞标准分析中，在两个地方使用了降维技术，特征提取和可视化。特征提取我们都知道用的是PCA，在数据分析领域是比较常见的一种主成分提取的方法，...

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我们已经知道scanpy是一个由Python组织的功能强大的单细胞数据分析工具，用的顺手的同时，我们不禁要问：她是如何组织的？于是，我们尝试阅...

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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：PAGA轨迹推断单细胞转录组数据分析||...

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单细胞转录组技术是来解释细胞状态的有力武器，在分群得到不同细胞类型的划分之前，有时候需要消除细胞周期的影响。毕竟同样的细胞类型也有着不同的状态，...

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什么是RNA 速率（RNA velocity） RNA速率能够通过叠加剪接信息来推断细胞分化的方向性。随着令人震惊的发现，未剪接和剪接的mRN...

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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：PAGA轨迹推断随着单细胞技术的成熟，测...

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单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类说起轨迹推断，很多人的第一印象就是monocle的轨迹图，大概率是长这样子的：如果说...

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scanpy 是一个用于分析单细胞转录组（single cell rna sequencing)数据的python库，文章2018发表在Geno...

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