上一步差异表达分析拿到了表达谱【比如当用药物处理之后，实验组中哪些基因的表达发生了变化】 GO数据库 Gene Ontology 允许在各种水...

一.样本表达分布 箱式图 小提琴图 概率密度分布图 以上三个图结合起来可以看总体样本表达分布图 二.样本的相关性 层次聚类树————通过计算点与...

RPKM/FPKM 箱式图 过滤后和过滤前的前四行前四列可以看到ENSG00000000005已经不存在了【过滤的意义就是去掉空的】

featureCounts 常用参数 salmon定量————不需要比对直接得到参考基因组表达

使用两个软件对fq数据进行比对，得到比对文件sam/bam，并探索比对结果。三个常用参考基因组数据库：Ensembl：www.ensembl.o...

转录组分析总流程 数据质控 背景知识 数据量的统计方式image.png sra转换成fastq 质控 image.pngBut what do...

从上到下依次是：名字，物种，实验类型，对整个文章的概述 从GEO数据库中得到SRA的数据编号 数据下载 sra下载 aspera下载 ENA数据...

文献学习 【要做笔记】1.A comprehensive evaluation of normalization methods for ill...