30篇文章 · 48154字 · 29人关注
-
空间数据可视化：2D or 3D？
尽管我们对3D的和交互的动图有某种偏好，但是长久以来主流期刊杂志依然以2D的静态图为主。这当然与现在的媒体技术有关，虽然多媒体技术已经允许我们这...
-
SPATA：基因集驱动的空间转录组分析框架SPATA - SPAtial Transcriptomic Analysis : 空间转录组分析-提供了一个R函数和交互应用的工具，使空间转...
-
空间转录组如何寻找感兴趣区域（ROI）
有过计算机视觉和影像组学数据分析经验的朋友，对感兴趣区域（region of interest，ROI）不会感到陌生。感兴趣区域就像它的字面意思...
-
trendsceek || 识别基因空间表达趋势空间转录组技术使得我们可以在组织成像的基础上考察基因表达情况，同时也需要新的分析策略。trendsceek是一种基于标记点过程的方法，识别具有显...
-
STUtility || 空间转录组多样本分析框架（二）前情回顾：应用空间统计学分析空间表达数据[https://www.jianshu.com/p/1f48ff89be8a]空间信息在空间转录组中的...
-
STUtility || 空间转录组多样本分析框架（一）应用空间统计学分析空间表达数据[https://www.jianshu.com/p/1f48ff89be8a]空间信息在空间转录组中的运用[ht...
-
空间转录组教程||用BayesSpace提高分群和基因分辨率最近开发的空间基因表达技术，如空间转录组学可以在保留空间背景的同时，全面测量转录组谱。然而，现有的空间基因表达数据分析方法往往不能有效利用空间信...
-
用ImageJ处理空间成像数据我们经常看到Visium 空间转录组报告中有图像数据，那么它是怎么得的呢？今天给大家演示一下用ImageJ来处理空间图像数据，尽管这只是Imag...
-
SpatialExperiment || 空间数据管理我们知道单细胞数据的激增和它的高维特征催生了针对单细胞数据的数据格式：Seurat对象、singlecellexperiment对象以及annd...
文集作者
