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转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(3)
对于没有Org.Db的非模式生物，由于某些原因不制作Org.Db，然后利用clusterProfiler做富集 数据格式 数据准备 富集分析绘图
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转录组分析(11) - GO/KEGG富集分析(1)
简介 bioconductor介绍[http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignette...
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转录组分析(8) - 可变剪接
真核生物大部分基因含有内含子，转录完成后产生的mRNA前体需要经过一系列复杂的加工，成为成熟的mRNA，转移到细胞质中才能发挥功能。可变剪接（A...
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转录组分析(7) - 比对
对比（Mapping）就是通过局部比对将短的reads定位到参考基因组上，以共后续分析使用。序列比对的过程包括：首先对参考基因组建立索引，建立索...
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转录组分析(5) - 无参转录组拼接(illumina)目的 NGS测序得到的短序列（read）存储于Fastq文件，在经过DNA建库和测序之后，文件中不同read之间的顺序就全部丢失了。因此，Fas...
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转录组分析(6) - 基因注释目的 基因功能的注释依赖于基因结构或者序列，将基因序列或蛋白序列和主流数据库进行比对获取该基因的功能信息，最终对预测的编码基因进行功能注释，从而...
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转录组分析(4) - 预处理目的 经过fastqc进行质量控制之后，我们能够发现在fastq数据里存在着一些会影响下游分析的因素，包括adapter和低质量reads等。因...
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转录组分析(3) - 质量控制目的 现在的NGS测序，以illumina为首基本都是运用边合成边测序的技术。碱基的合成依靠的是化学反应，这使得碱基链可以不断地从5'端一直往3...
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转录组分析(2) - 软件安装
conda环境创建 conda create -n py3 python=3.8conda create -n py2 python=2.7 数...
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