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今天我们尝试复现一个热图,下面图C的右边部分。 下载附表的原始数据。 首先加载需要的包: library(xlsx) library(Compl...
我们今天学习如何利用complexheatmap添加缩放和链接注释,以及如何加入词云图等。 前面我们测试过,热图中有很多行或列,但是我们只想标记...
后面我们会陆陆续续有个系列,跟着别人好的paper中的图进行学习,试着重复别人图中的效果,来加强自己的学习。 今天就来测试和学习下面这个pape...
我们从今天开始,学习应用complexheatmap的基本知识画一些好看的例子。数据和例子信息参考官方链接: https://jokergoo....
接着上个帖子,这个帖子主要学习文字注释的一些技巧。 1. 文字注释 文本可以用anno_text()注释。图形参数由gp控制。 ha = row...
热图注释是热图的重要组成部分,它显示与热图中的行或列相关联的附加信息,也是一个看起来高水平热图的主要原因。 ComplexHeatmap包为设置...
热图(Heatmap)是矩阵类型数据最为常用的可视化方法,在生物学领域常用于各种组学数据的可视化,例如基因表达量数据、物种丰度分布、表观遗传信号...
以前做序列比对通常都是MEGA来做,然后有时候会用genedoc来展示,但是经常碰到一个问题就是没办法得到矢量图。所以一直在想用R能不能展示多序...
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行...
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