上一篇笔记里练习了如何使用WDL+Cromwell来打印hello world。这篇笔记就来练习一下运行GATK的haplotypeCaller...

视频地址：这里，这是Broad Institute团队GATK系列视频的最后一讲，主要是给学生演示如何使用WDL运行任务。WDL的教程，GATK...

这篇笔记是几个视频内容的综合，每个视频里我只选取了几张PPT。主讲人举例了一篇已经发表的文章来进行具体的流程分析。这篇文章里的外显子数据分析基本...

这一视频讲的是somatic variants discovery，主要是集中在肿瘤样品上。视频地址：here 下面这幅图简单的展示了在肿瘤环境...

这篇笔记是这个系列视频的第5讲，笔记有的是用英文记的，有的用中文。因为是用零碎的时间来看视频记笔记，所以用英语还是中文看当时的心情。。。 视频地...

视频地址：https://www.youtube.com/watch?v=dgzkXLfFAf8&list=PLjiXAZO27elDHGlQw...

无意间发现了油管上有一个系列视频，是Broad Institute在去年发布的课程，这个课程主要是对GATK第4版进行的一个系统的介绍。所以我也...

这篇笔记是对GATK官网上发布的寻找突变体之前的数据预处理这一块内容的学习笔记。实际上也是一篇翻译笔记。原文在这里，是发表在20多天前的，是一个...