
直接上操作吧 然后就可以画图了,我们这里用ego_bp来画 目前就先写到GO吧。匆匆学习终究还是只得皮毛,权做日后复习只用,希望日后继续把这个坑填完
我们已经得到了一个表达矩阵,下面我们就用DEseq2筛选差异表达基因,并进行简单的visulization。 DESeq流程 第一步我们需要准备...
到这里我们移师R,由于R是一个可视化的软件,我们下载Windows版的R就好了。这里我们讲一讲一些必要R包的安装,最后把上一步的表达矩阵做一个合...
我们用htseq-count,理论部分参见https://www.jianshu.com/p/e9742bbf83b9。 read计数 在开始计...
这里算是正式进入了RNA-seq的数据分析阶段。第一个工序是序列比对。比对的基本原理就是将打断后的read回贴到index上。具体理论部分参考h...
一觉醒来,数据下载完了,从NCBI下载的数据是一个高度压缩的sra文件,我们需要先解压成fastq文件。进一步的质控可以看看测序的质量。到这里你...
这部分我们正式开始RNA-seq的流程,我们用生信技能树的例子进行操作。在这一部分中,我们主要关注如何从文献中得到数据。原文链接:https:/...
这一部分主要是关于安装包管理软件miniconda已经miniconda的使用,在徐洲更哥哥的b站教程里有非常非常详细的讲解,跟着做几乎不会踩坑...
写在最前面 大概也是受到了【时代灰尘】的重压,原来的实验计划全盘打乱,本来计划利用疫情期间要写完的综述看起来也要虎头蛇尾了。在经历了一个惨淡的保...
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