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13篇文章 · 22218字 · 41人关注
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    群体进化选择消除分析

    要做选择性消除分析,首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说: 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的,而是由中性/近中...

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    基因流分析——Treemix

    基本概念: 基因流(也称基因迁移) 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入...

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    基因流分析——D统计

    基本概念 基因渗入(introgression): 是在遗传学中,指两个基因库间的基因流动,通常是经过种间杂交产生。基因渗入是一个长期的过程,它...

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    群体遗传学统计指标——种群核苷酸多样性

    理论 种群核苷酸多样性,顾名思义指的就是核苷酸多样性,值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性,也可以用来推演进化关系。计算...

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    群体结构——系统发育树的构建

    最近杂事真的非常的满,终于找到时间更新一下。。。。 通过上一篇文章的介绍,系统发育树的基本概念[https://www.jianshu.com/...

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    基因组比对结果的可视化

    IGV(Integrative Genomics Viewer)是一款本地使用的基因组可视化神器,不管你用何种系统基本上都可找到对应的安装包,方...

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    群体结构——Structure堆叠图详细画法

    基本概念 基迪奥有篇文章写得非常的简单明了,我这里就不再赘述,大家移步去搞清楚基本知识。 群体结构图形——structure堆叠图[https:...

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    群体结构——PCA分析

    概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也称主分量分析,旨在利用降维的思想,把多指标转...

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    群体遗传学亲缘关系分析

    亲缘关系分析实操 前期准备 给标记加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈现,拿到VCF文件的第一件事情就是添加各个SNP位点的ID...

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